Protein–RNA interactions for Protein: Q62266

Sprr1a, Cornifin-A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1aQ62266 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1aQ62266 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms