Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsx2Q61412 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms