Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms