Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms