Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms