Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa20Q45VN2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms