Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca4bQ3UW98 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms