Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr1d1Q3UV55 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms