Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt2Q3TTY5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms