Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms