Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GABPB1Q06547 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms