Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox9Q04887 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms