Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs2Q03350 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms