Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms