Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms