Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms