Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba4aP68368 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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