Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms