Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prox1P48437 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms