Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms