Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxraP28700 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxraP28700 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxraP28700 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxraP28700 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxraP28700 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RxraP28700 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RxraP28700 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxraP28700 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RxraP28700 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RxraP28700 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RxraP28700 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RxraP28700 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxraP28700 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxraP28700 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms