Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Hoxd10P28359 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Hoxd10P28359 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Hoxd10P28359 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Hoxd10P28359 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Hoxd10P28359 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd10P28359 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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