Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NdnP25233 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NdnP25233 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NdnP25233 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NdnP25233 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NdnP25233 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NdnP25233 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NdnP25233 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NdnP25233 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NdnP25233 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NdnP25233 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms