Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms