Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ggta1P23336 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms