Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms