Protein–RNA interactions for Protein: P18608

Hmgn1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn1P18608 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn1P18608 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn1P18608 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn1P18608 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn1P18608 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn1P18608 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn1P18608 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn1P18608 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn1P18608 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn1P18608 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn1P18608 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn1P18608 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn1P18608 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn1P18608 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn1P18608 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgn1P18608 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn1P18608 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn1P18608 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn1P18608 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn1P18608 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn1P18608 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgn1P18608 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms