Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms