Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms