Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms