Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkcO88445 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms