Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF253O75346 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ZNF253O75346 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ZNF253O75346 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ZNF253O75346 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZNF253O75346 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF253O75346 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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