Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlkO54988 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlkO54988 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlkO54988 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlkO54988 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms