Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a6O35544 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms