Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ArxO35085 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ArxO35085 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ArxO35085 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ArxO35085 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ArxO35085 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ArxO35085 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ArxO35085 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ArxO35085 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ArxO35085 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ArxO35085 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ArxO35085 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ArxO35085 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ArxO35085 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ArxO35085 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ArxO35085 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ArxO35085 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ArxO35085 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ArxO35085 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ArxO35085 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ArxO35085 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ArxO35085 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ArxO35085 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ArxO35085 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ArxO35085 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms