Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ14

Gm4791, Predicted gene 4791, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4791J3QQ14 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4791J3QQ14 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms