Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GOPCQ9HD26 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms