Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC009955.1-201ENST00000455896 271 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RN7SL541P-201ENST00000464317 283 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RN7SL65P-201ENST00000485221 315 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RN7SL272P-201ENST00000487762 289 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RN7SL472P-201ENST00000492799 293 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 SNRPCP14-201ENST00000524498 205 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AP003532.1-201ENST00000529936 310 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AMN1-207ENST00000536761 1025 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC015674.1-201ENST00000578482 267 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC005498.2-201ENST00000590579 326 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 MIR7847-201ENST00000610912 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL109933.4-201ENST00000612111 157 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ZEB2-AS1-201ENST00000421083 453 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC011999.1-201ENST00000424794 1024 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ADAM3A-206ENST00000484602 1046 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms