Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms