Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CBFBQ13951 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms