Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms