Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DNASE1L3Q13609 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms