Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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