Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GPS1Q13098 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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