Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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