Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms