Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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