Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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PTPRAP18433 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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