Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXD8P13378 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXD8P13378 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXD8P13378 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXD8P13378 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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