Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms